MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 55991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015574	T	8	8	49026	49033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015574	T	7	7	49035	49041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015574	A	8	8	49044	49051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015574	T	6	6	49091	49096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015574	TGAA	2	8	49107	49114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015574	T	7	7	49134	49140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015574	TTG	2	6	49143	49148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015574	T	6	6	49230	49235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015574	ATT	2	6	49331	49336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986287
1010	NC_015574	T	7	7	49335	49341	0 %	100 %	0 %	0 %	333986287
1011	NC_015574	GCG	2	6	49368	49373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986287
1012	NC_015574	CGG	2	6	49412	49417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986287
1013	NC_015574	ACA	2	6	49453	49458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
1014	NC_015574	ATG	2	6	49570	49575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986287
1015	NC_015574	CAACA	2	10	49583	49592	60 %	0 %	0 %	40 %	333986287
1016	NC_015574	CTGTT	2	10	49612	49621	0 %	60 %	20 %	20 %	333986287
1017	NC_015574	ACA	2	6	49656	49661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
1018	NC_015574	CAA	2	6	49690	49695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
1019	NC_015574	AAT	2	6	49710	49715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
1020	NC_015574	TGG	2	6	49724	49729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1021	NC_015574	TCG	2	6	49861	49866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986287
1022	NC_015574	TGG	2	6	49928	49933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1023	NC_015574	ACA	2	6	49984	49989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
1024	NC_015574	TAT	2	6	50120	50125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986287
1025	NC_015574	ACA	2	6	50152	50157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
1026	NC_015574	TGG	2	6	50171	50176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1027	NC_015574	CTT	2	6	50203	50208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986287
1028	NC_015574	TGG	2	6	50249	50254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1029	NC_015574	ATA	2	6	50263	50268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
1030	NC_015574	TGG	2	6	50327	50332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1031	NC_015574	CTA	2	6	50356	50361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986287
1032	NC_015574	CAA	2	6	50393	50398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
1033	NC_015574	TAA	2	6	50405	50410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
1034	NC_015574	TGG	2	6	50411	50416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1035	NC_015574	CAG	2	6	50479	50484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986287
1036	NC_015574	TAA	2	6	50504	50509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
1037	NC_015574	GGT	2	6	50529	50534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1038	NC_015574	CAA	2	6	50543	50548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
1039	NC_015574	TGG	2	6	50564	50569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1040	NC_015574	TA	3	6	50583	50588	50 %	50 %	0 %	0 %	333986287
1041	NC_015574	AGT	2	6	50664	50669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986287
1042	NC_015574	CTA	3	9	50680	50688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986287
1043	NC_015574	GTA	2	6	50731	50736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986287
1044	NC_015574	AAT	2	6	50772	50777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
1045	NC_015574	TGG	2	6	50778	50783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1046	NC_015574	CTG	2	6	50869	50874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986287
1047	NC_015574	AGTT	2	8	50900	50907	25 %	50 %	25 %	0 %	333986287
1048	NC_015574	CAA	2	6	50909	50914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
1049	NC_015574	ATG	2	6	50920	50925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986287
1050	NC_015574	TGG	2	6	50972	50977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1051	NC_015574	TGT	2	6	50978	50983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986287
1052	NC_015574	TCA	2	6	50997	51002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986287
1053	NC_015574	CAG	2	6	51022	51027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986287
1054	NC_015574	CAA	2	6	51046	51051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
1055	NC_015574	CGG	2	6	51094	51099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986287
1056	NC_015574	ACAT	2	8	51117	51124	50 %	25 %	0 %	25 %	333986287
1057	NC_015574	CCA	2	6	51208	51213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986287
1058	NC_015574	TGA	2	6	51281	51286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986287
1059	NC_015574	TACGT	2	10	51299	51308	20 %	40 %	20 %	20 %	333986287
1060	NC_015574	GTA	2	6	51361	51366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986287
1061	NC_015574	GTT	2	6	51402	51407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986287
1062	NC_015574	ATGTTT	2	12	51418	51429	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333986287
1063	NC_015574	TACAA	2	10	51482	51491	60 %	20 %	0 %	20 %	333986287
1064	NC_015574	TAC	2	6	51532	51537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986287
1065	NC_015574	TAA	2	6	51560	51565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
1066	NC_015574	ATA	2	6	51621	51626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
1067	NC_015574	TGG	2	6	51719	51724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1068	NC_015574	ACA	2	6	51775	51780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
1069	NC_015574	TAAC	2	8	51784	51791	50 %	25 %	0 %	25 %	333986287
1070	NC_015574	TGG	2	6	51797	51802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1071	NC_015574	CTT	2	6	51829	51834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986287
1072	NC_015574	GGT	2	6	51891	51896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
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1081	NC_015574	AAT	2	6	52143	52148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
1082	NC_015574	AAT	2	6	52155	52160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
1083	NC_015574	TGG	2	6	52205	52210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1084	NC_015574	CAA	2	6	52262	52267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
1085	NC_015574	GTG	2	6	52282	52287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1086	NC_015574	AAT	2	6	52296	52301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
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1089	NC_015574	TGG	2	6	52410	52415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
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1092	NC_015574	TAA	2	6	52544	52549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
1093	NC_015574	TGT	2	6	52613	52618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986287
1094	NC_015574	TAA	2	6	52654	52659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
1095	NC_015574	CAC	2	6	52664	52669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986287
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1097	NC_015574	TTA	2	6	52720	52725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986287
1098	NC_015574	CAA	2	6	52729	52734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
1099	NC_015574	GTT	2	6	52824	52829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986287
1100	NC_015574	ATG	2	6	52840	52845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986287
1101	NC_015574	TAT	2	6	52860	52865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986287
1102	NC_015574	TCAA	2	8	52950	52957	50 %	25 %	0 %	25 %	333986287
1103	NC_015574	TA	3	6	52963	52968	50 %	50 %	0 %	0 %	333986287
1104	NC_015574	TA	3	6	52973	52978	50 %	50 %	0 %	0 %	333986287
1105	NC_015574	CA	3	6	52979	52984	50 %	0 %	0 %	50 %	333986287
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1107	NC_015574	TAC	2	6	53090	53095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986287
1108	NC_015574	TAT	2	6	53100	53105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986287
1109	NC_015574	TGA	2	6	53111	53116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986287
1110	NC_015574	CAGTG	2	10	53195	53204	20 %	20 %	40 %	20 %	333986287
1111	NC_015574	TGC	2	6	53207	53212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986287
1112	NC_015574	C	6	6	53261	53266	0 %	0 %	0 %	100 %	333986287
1113	NC_015574	GAT	2	6	53334	53339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986287
1114	NC_015574	TTA	2	6	53354	53359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986287
1115	NC_015574	CAC	2	6	53360	53365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986287
1116	NC_015574	TGC	2	6	53441	53446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986287
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1118	NC_015574	GCAGT	2	10	53539	53548	20 %	20 %	40 %	20 %	333986287
1119	NC_015574	GT	3	6	53674	53679	0 %	50 %	50 %	0 %	333986287
1120	NC_015574	TCAT	2	8	53731	53738	25 %	50 %	0 %	25 %	333986287
1121	NC_015574	CTG	2	6	53821	53826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986287
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1123	NC_015574	ATA	2	6	53938	53943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
1124	NC_015574	GGT	2	6	54254	54259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
1125	NC_015574	GT	3	6	54286	54291	0 %	50 %	50 %	0 %	333986287
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1127	NC_015574	AAC	2	6	54378	54383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
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